Theo nội dung Cáo trạng của VKSND tỉnh Thanh Hóa: Trong các năm 2017, 2018, 2019 do Trường Cao đẳng công nghiệp tuyển sinh không đủ chỉ tiêu dẫn đến các nguồn thu từ học phí, kinh phí chi thường xuyên được cấp theo định mức học sinh không đảm bảo để chi trả lương và chi các hoạt động thường xuyên của Trường. Để tăng thêm kinh phí cho hoạt động chi tiêu của trường các bị can Nguyễn Văn Hùng, Nguyễn Giang Quân, Lê Đình Đặng đã bàn bạc, thống nhất thực hiện trái quy định của điểm c khoản 1 Điều 5 Thông tư liên tịch số 09/2016/TTLT-BGDĐT-BTC-BLĐTBXH và Nghị quyết số 25/2016/NQ-HĐND ngày 08/12/2016 của HĐND tỉnh Thanh Hóa, Quyết định số 4762/2016/QĐ-UBND ngày 09/12/2016 của UBND tỉnh Thanh Hóa: báo cáo không đúng số học sinh học thực tế tại trường, không giảm trừ số học sinh THCS học tiếp lên trình độ trung cấp đã bỏ học, có quyết định xóa tên mà vẫn kê khai danh sách để đề nghị quyết toán kinh phí chi thường xuyên cấp theo định mức học sinh và kinh phí cấp bù miễn giảm học phí dẫn đến khi xét duyệt quyết toán, Sở Tài chính tỉnh Thanh Hóa không phát hiện được số liệu báo cáo sai nên đã quyết toán kinh phí theo đề nghị dẫn đến gây thiệt hại cho ngân sách nhà nước tổng số tiền 6.616.215.000 đồng, trong đó kinh phí chi thường xuyên cấp theo định mức học sinh là 4.788.050.000 đồng, kinh phí cấp bù miễn giảm học phí là 1.828.165.000 đồng. Toàn bộ số tiền trên được sử dụng vào chi các hoạt động chung của Trường Cao đẳng công nghiệp.

Trong vụ án, Nguyễn Văn Hùng là Hiệu trưởng, đã thống nhất cùng các bị can thực hiện trái quy định của pháp luật, ký báo cáo tài chính có số liệu không đúng thực tế để đề nghị Sở Tài chính duyệt quyết toán nên giữ vai trò chính; Nguyễn Giang Quân là Kế toán trưởng trực tiếp tham mưu cho bị can Hùng về việc thực hiện trái quy định pháp luật nên giữ vai trò sau bị can Hùng; Lê Đình Đặng là Kế toán viên biết rõ việc làm là vi phạm pháp luật nhưng vẫn thống nhất và thực hiện tích cực, có vai trò sau bị can Hùng và Quân.

Tại phiên tòa, Kiểm sát viên được phân công thực hành quyền công tố, kiểm sát xét xử vụ án đã kiểm sát chặt chẽ thủ tục tố tụng, việc chấp hành pháp luật của người tiến hành tố tụng, người tham gia tố tụng và những người tham dự phiên tòa; thực hiện việc xét hỏi, tranh luận, đối đáp đầy đủ, thuyết phục để làm rõ hành vi phạm tội của các bị cáo. Lời luận tội của Kiểm sát viên đã phân tích, đánh giá chứng cứ cũng như tính chất, mức độ nguy hiểm cho xã hội do hành vi phạm tội của các bị cáo thực hiện, đồng thời cân nhắc các tình tiết tăng nặng, giảm nhẹ trách nhiệm hình sự và đề nghị mức hình phạt phù hợp với hành vi do các bị cáo gây ra.

Kết thúc phiên tòa, căn cứ vào hồ sơ vụ án, kết quả xét hỏi, tranh tụng, các tài liệu, chứng cứ đã được làm rõ tại phiên tòa, quan điểm của Viện kiểm sát và các quy định của pháp luật, Hội đồng xét xử đã tuyên phạt bị cáo Nguyễn Văn Hùng 5 năm 6 tháng tù, Nguyễn Giang Quân 5 năm tù, Lê Đình Đặng 3 năm tù về tội “Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ” theo khoản 3 điều 356 Bộ luật hình sự.